擅长呼吸系统疾病如慢性阻塞性疾病（COPD）、支气管哮喘及肺栓塞的规范化诊断与治疗。对呼吸系统疾病相关的呼吸力学、气体交换及呼吸生理有较深的造诣。紧紧跟踪国际及国内COPD、支气管哮喘及肺栓塞的诊断及治疗的指南及新技术新理论，并及时密切与临床实践相结合。在上海市积极提倡并率先开展肺栓塞的诊断及治疗，他所领导的科室在肺栓塞的诊断及治疗技术水平在上海处于于领先水平。刘锦铭教授积极提倡并开展对COPD、支气管哮喘规范化诊断与治疗及康复治疗，在COPD肺减容手术（LVRS）及肺移植手术的术前呼吸功能康复、受体的选择、围术期并发症的诊断及处治均有较丰富的经验，在上海也处于领先水平。目前承担该领域上海市卫生局科研课题一项。对急慢性呼吸衰竭的抢救治疗及对疑难呼吸系统疾病的诊断及鉴别诊断也具有很丰富的经验。 近年发现肺栓塞为呼吸系统一常见病及多发病，急性期如未及时正确诊断及治疗有一定的死亡率且遗留严重并发症，为一严重危害人民健康的疾病。由于肺栓塞的临床症状缺乏特异性，诊断对经验要求高，因此目前肺栓塞在国内的漏诊误诊 情况极其严重，上海尤其突出。刘锦铭教授目前承担的上海市科委科研课题“死腔及肺内分流的诊断技术对肺栓塞诊断价值”的研究目的就在于提高肺栓塞的诊断率。